Krypty pod františkánskym kostolom sú po kaštieli druhou najnavštevovanejšou pamiatkou v Malackách. S obľubou ich spoznávajú všetky generácie, od najmenších škôlkarov až po seniorov.
Krypty vyhľadávajú aj zahraniční návštevníci, túto sezónu ich navštívili turisti nielen z európskych krajín, ale aj z ďalekej Kanady, Nového Zélandu či Taiwanu.
Krypty nie sú iba pálffyovským pohrebiskom, ale sú tu pochovaní aj členovia františkánskeho rádu a niektorí významní občania mesta. Hrobky boli zrekonštruované v rokoch 1993-1994 a v súčasnosti sú vysunutou expozíciou Múzea Michala Tillnera. Slúžia aj ako lapidárium historických sôch z mesta. Keďže pracovníci múzea nazhromaždili množstvo nových poznatkov o histórii krýpt a každý rok sa počet návštevníkov zvyšuje, zastaranú expozíciu bolo potrebné zmodernizovať a doplniť ju o nový a pútavý materiál zodpovedajúci nárokom 21. storočia. Bol zakúpený nový mobiliár a expozíciu doplnili nové informačné panely schopné odolávať vlhkosti. Prehliadku krýpt dopĺňa projekcia starých fotografií, ktoré obohacujú a spestrujú výklad sprievodcu. Múzeum Michala Tillnera vydalo novú brožúru o tejto pamiatke.
Rekonštrukcia expozície v kryptách bola financovaná z dotácie Bratislavského samosprávneho kraja.
